萌學園，傳說成立的時間是在地球誕生的年代，是一所由夸克族人組成的魔法學校，隱藏在地球大氣層外平行空間裡，並由萌騎士幻之星（李昂霖 飾）、炎之星（劉書宏 飾）、智之星（林奕勳 飾）、十之星（翁瑞迪 飾）、月之星（蔡孟穎 飾），代代相傳，守護地球的和平。

在一次搶救魔法生物的任務中，意外引來宇宙中的黑色力量莫爾斯（傅冠傑 飾），威脅萌騎士交出磐古，召喚出萌學園的過去，否則將用魔法抽乾地球水資源，讓所有生命乾涸而死！

「磐古」，究竟是什麼？為了拯救地球，萌騎士們踏上尋找磐古的旅程，竟發現磐古的神秘力量與自己的魔法有著密不可分的連結，然而要付出什麼代價才能阻止莫爾斯奪走磐古？與萌騎士一起面對跟地球共存亡的關鍵戰役！